Дефицит воды является одним из глобальных рисков в засушливых и полузасушливых регионах, таких как Центральная Азия (ЦА), включая Кыргызстан и Казахстан. Основные реки ЦА являются трансграничными, как, например, бассейн рек Чу и Талас, которые находятся на территории Кыргызстана и Казахстана. Природные и антропогенные факторы, такие как изменение климата, могут привести к водным кризисам и конфликтам из-за снижения водоснабжения и ухудшения качества воды. К сожалению, в ЦА в основном изучаются поверхностные водные ресурсы, а ресурсы подземных вод исключены из открытого аналитического анализа. В то же время подземные воды являются жизненно важным компонентом экосистемы речных бассейнов и должны изучаться одновременно с поверхностными водами, чтобы получить более полный анализ устойчивости интегрированной системы поверхностных, подземных вод бассейна. Комбинированные научные исследования поверхностных, подземных вод, прогноз водного баланса бассейнов связаны с большими сложностями трансграничной кооперации специалистов – метеорологов, гидрологов, гидрогеологов граничащих государств. В основном в трансграничных переговорах преобладает ведомственное управление, больше административное управление, без системного планирования, анализа адаптации и подготовки к естественным природным процессам, без стимулирования вовлечения местного населения, студентов школ, колледжей, университетов в изучение, без проведения полевых водных исследований, моделирования водных балансов поверхностных, подземных вод бассейнов. Местные жители аулов бассейнов рек Кыргызстана и Казахстана нуждаются в усилении совместной поддержки повышения квалификации населения, возможностей адаптации к изменению климата в цепочке школа – колледж – индустрия – университет. Совместные гидрогеологические исследования естественных природных процессов в Кыргызстане и Казахстане плохо отработаны. Кыргызстан, Казахстан упускают возможности совместной кооперации. Во многих странах сейчас идет «золотая лихорадка» гидрогеологических исследований, исследований по природному геологическому «белому» водороду, в том числе на границе Франции и Германии, где обнаружены крупнейшие мировые подземные запасы водорода. На территории трансграничного бассейна рек Мозель, Саар, где расположены заброшенные более 20 лет назад угольные шахты, обнаружены большие объемы природного геологического «белого» водорода с оцениваемым объемом до 250 млн тонн с циклом возобновления выработки в подземных «фабриках» водорода около 80 лет – средний цикл человеческой жизни. Подземным «фабрикам» водорода важна подпитка воды для физико-химических окислительных процессов серпентинизации, радиолиза, что является важным для согласования представителями трансграничного бассейна рек Мозель, Саар – Франции и Германии. Кыргызстану с Казахстаном важно усилить кооперацию с созданием стимулов роста, поддержкой исследователей ученых-гидрогеологов, созданием совместных киргизско-казахстанских бассейновых колледжей подготовки техников по водным ресурсам, водородным технологиям, аналогично тому, как делается в других странах. В настоящем обзоре представлены возможности усиления кооперации Кыргызстана и Казахстана, в том числе по совместному эффективному управлению природными ресурсами, изучению гидрогеологии Кыргызстана, Казахстана для эффективного совместного использования водородно-водных ресурсов двух стран.